Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28036V9GXJ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm28036V9GXJ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm28036V9GXJ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms