Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept6Q9R1T4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept6Q9R1T4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept6Q9R1T4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept6Q9R1T4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept6Q9R1T4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept6Q9R1T4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sept6Q9R1T4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sept6Q9R1T4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sept6Q9R1T4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept6Q9R1T4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept6Q9R1T4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms