Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PnckQ9QYK9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms