Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC3

Bhlha15, Class A basic helix-loop-helix protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha15Q9QYC3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Bhlha15Q9QYC3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlha15Q9QYC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlha15Q9QYC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlha15Q9QYC3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlha15Q9QYC3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlha15Q9QYC3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlha15Q9QYC3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlha15Q9QYC3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlha15Q9QYC3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlha15Q9QYC3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlha15Q9QYC3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlha15Q9QYC3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlha15Q9QYC3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms