Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad18Q9QXK2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 323.8 ms