Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm4Q9QXA5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lsm4Q9QXA5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms