Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfr2Q9JKX3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfr2Q9JKX3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfr2Q9JKX3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms