Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap3m1Q9JKC8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3m1Q9JKC8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms