Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf2Q9JJ80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpf2Q9JJ80 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.5 ms