Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc22Q9JIG7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms