Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap29Q9ERB0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap29Q9ERB0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap29Q9ERB0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap29Q9ERB0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap29Q9ERB0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap29Q9ERB0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap29Q9ERB0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms