Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfcp2Q9ERA0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfcp2Q9ERA0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfcp2Q9ERA0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfcp2Q9ERA0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfcp2Q9ERA0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfcp2Q9ERA0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfcp2Q9ERA0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfcp2Q9ERA0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms