Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SgshQ9EQ08 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgshQ9EQ08 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SgshQ9EQ08 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms