Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a1Q9EPE9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a1Q9EPE9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a1Q9EPE9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a1Q9EPE9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a1Q9EPE9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.5 ms