Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xab2Q9DCD2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xab2Q9DCD2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Xab2Q9DCD2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms