Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim23Q9DAL0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim23Q9DAL0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim23Q9DAL0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms