Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd2Q9D8U0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd2Q9D8U0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms