Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp19Q9D7A6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp19Q9D7A6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.5 ms