Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Zcchc13Q9D548 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zcchc13Q9D548 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zcchc13Q9D548 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Zcchc13Q9D548 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Zcchc13Q9D548 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Zcchc13Q9D548 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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