Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam227bQ9D518 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam227bQ9D518 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam227bQ9D518 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam227bQ9D518 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227bQ9D518 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam227bQ9D518 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms