Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubgcp4Q9D4F8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms