Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnaaf1Q9D2H9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnaaf1Q9D2H9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnaaf1Q9D2H9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dnaaf1Q9D2H9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnaaf1Q9D2H9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnaaf1Q9D2H9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.9 ms