Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hddc3Q9D114 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hddc3Q9D114 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hddc3Q9D114 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hddc3Q9D114 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hddc3Q9D114 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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