Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lsm12Q9D0R8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lsm12Q9D0R8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsm12Q9D0R8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms