Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZY3

Ube2v1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2v1Q9CZY3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2v1Q9CZY3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2v1Q9CZY3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2v1Q9CZY3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2v1Q9CZY3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2v1Q9CZY3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2v1Q9CZY3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2v1Q9CZY3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2v1Q9CZY3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms