Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp11Q9CZJ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp11Q9CZJ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms