Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdhd3Q9CYW4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdhd3Q9CYW4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms