Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snw1Q9CSN1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snw1Q9CSN1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms