Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029F12RikQ9CRB4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700029F12RikQ9CRB4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700029F12RikQ9CRB4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms