Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smim8Q9CQQ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms