Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms