Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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