Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms