Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim3Q99PE5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim3Q99PE5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms