Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtpbp4Q99ME9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gtpbp4Q99ME9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtpbp4Q99ME9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtpbp4Q99ME9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtpbp4Q99ME9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtpbp4Q99ME9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtpbp4Q99ME9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtpbp4Q99ME9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtpbp4Q99ME9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtpbp4Q99ME9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtpbp4Q99ME9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtpbp4Q99ME9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtpbp4Q99ME9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtpbp4Q99ME9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms