Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gins4Q99LZ3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins4Q99LZ3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms