Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm3Q99LJ5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms