Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SmagpQ99KC7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SmagpQ99KC7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms