Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ufsp2Q99K23 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ufsp2Q99K23 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms