Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apol9aQ8VDU3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apol9aQ8VDU3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9aQ8VDU3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apol9aQ8VDU3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol9aQ8VDU3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms