Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc12Q8R344 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc12Q8R344 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms