Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CipcQ8R0W1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CipcQ8R0W1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CipcQ8R0W1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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