Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssh3Q8K330 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssh3Q8K330 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssh3Q8K330 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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