Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkd3Q8K1Y2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkd3Q8K1Y2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkd3Q8K1Y2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkd3Q8K1Y2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkd3Q8K1Y2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkd3Q8K1Y2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkd3Q8K1Y2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkd3Q8K1Y2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkd3Q8K1Y2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prkd3Q8K1Y2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prkd3Q8K1Y2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkd3Q8K1Y2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prkd3Q8K1Y2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms