Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc28bQ8CEG5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28bQ8CEG5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms