Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc87Q8CDL9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms