Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrif1Q8CDD9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Lrif1Q8CDD9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Lrif1Q8CDD9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrif1Q8CDD9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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