Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Podxl2Q8CAE9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Podxl2Q8CAE9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Podxl2Q8CAE9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Podxl2Q8CAE9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms