Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9H6

Strip2, Striatin-interacting proteins 2, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip2Q8C9H6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip2Q8C9H6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms