Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc159Q8C963 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc159Q8C963 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc159Q8C963 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms